Я могу брать дополнительную оплату за мою доставку в Магазине на Kaspi.kz?

Нет. По правилам работы с Магазином на Kaspi.kz партнерам запрещено брать дополнительную оплату за доставку с клиента.  

В этом случае применяются ограничительные меры вплоть до полного прекращения сотрудничества.