На меня оформлены несколько машин. Я могу оплатить долг по налогу на транспорт только за одну из них в мобильном приложении Kaspi.kz?

Нет. В мобильном приложении Kaspi.kz отображается общий долг по определённому типу налога. Если у вас две машины, то сумма долга будет по налогу на обе сразу.

Чтобы оплатить долг по одной из машин, нужно обратиться в управление государственных доходов по своему региону.